В сюжете аниме «Граница пустоты: Сад грешников (фильм четвертый)» два долгих года Микия Кокуто регулярно посещал больницу в которой находилась его близкая подруга Сики Рёги, впавшая в кому после сложной операции. Постоянно парень приносил букеты цветов и заботился о Сики хоть она и не видела этого. И вот однажды Сики выходит из комы. Этому событию безмерно рад Микия и весь медицинский персонал больницы, но только не сама Сики.
За это время многое изменилось в особенности с Сики, которая блуждая между границей жизни и смерти, совершила незабываемое путешествие, а так же приобрела новый дар — запретные Глаза Смерти. Новый дар совершенно не радует девушку, а наоборот убивает в ней любой интерес к жизни. Потеряв часть воспоминаний Сики больше не чувствует себя цельной личностью, а поиски самой себя даются ей крайне сложно. Но верные друзья Микия и Токо всячески стараются помочь Сики найти смысл в жизни.