Главная героиня психологического триллера «Скелеты Железного острова» — молодая женщина Мария работает в океанариуме и в одиночку воспитывает своего сына Диего. Однажды они отправляются на пароме на Железный остров, чтобы отдохнуть и весело провести время вдвоем. На время Мария засыпает, а проснувшись не обнаруживает сына. В панике она начинает поиски ребенка, но мальчика нигде нет.
По прибытию на остров Мария обращается в полицию, но поиски стражей порядка так же ни к чему не привели. После исчезновения сына мать не находит себе места. Попытки разыскать Диего доводят Марию до безумия, а процедура опознания тела и вовсе травмирует и без того расшатанную психику женщины. Мария верит, что ее сын жив и начинает вести собственное расследование, но оно будет проходит на грани игры воображения и реальности.