Герой художественного фильма «Теория заговора» — странноватый нью-йоркский таксист Джерри Флетчер отличается от большинства жителей мегаполиса не только своим эксцентричным поведением, но и верой в тайный заговор теневого правительства. Он постоянно анализирует информацию, услышанную от пассажиров, собирает вырезки из газет о терактах и различных покушениях, превратив увлечение теорией заговора в навязчивую идею. Джерри влюблен в очаровательную помощницу прокурора Элис Саттон, которая до сих пор не может оправится после убийства отца.
Он делится с ней своими догадками и предположениями, но Элис отказывается ему верить, думая, что парень слегка не в себе. Однако, все меняется, когда происходит событие, о котором Джерри ранее выдвигал предположения. Единственным человеком, который верит его словам о теории заговора оказывается Элис. Теперь за Джерри охотятся агенты секретной структуры, чтобы узнать откуда парень знает важную информацию и уничтожить его.