В сюжете легендарного фильма «Муха» талантливый ученый-изобретатель Сет Брандл проводит эксперименты по телепортации с мгновенным перемещением материи. Изначально Сет пробует телепортировать неодушевленные предметы, а затем переходит к животным. Так его опыты с обезьянами заканчивались гибелью животных, но последний эксперимент с бабуином прошел вполне удачно. Всеми своими открытиями ученый делится с симпатичной ему журналисткой Вероникой, которая документирует ход его работы, снимает фильм и даже пишет книгу о гениальной работе Сета.
Вскоре между Сетом и Вероникой начинается бурный роман, побудивший ученого поставить эксперимент на самом себе. Однако, в стерильную камеру вместе с Сетом залетает муха, в результате чего ученый начал видоизменяться. Сет стал сильным, мега сексуально активным, его вкусы в еде совершенно изменились, да и внешность стала значительно меняться. Сет начал превращаться в другое существо…