В центре сюжета приключенческого мультфильма «LEGO. Бэтмен: Супер-герои DC объединяются» — противостояние популярных супергероев злому гению Джокеру и компании злодеев-преступников, решившим захватить власть в Готэме. Больше всего Лекс Лютор мечтает получить престижную награду “Человек года”, но премию получает его злейший враг Брюс Уэйн. Правда торжество длилось недолго, вечеринку срывает появление Джокера и его друзей-суперзлодеев: Женщины-Кошки, Двуликого и Загадочника.
На помощь приходит Бэтмен и вскоре все злодеи оказываются в тюрьме, а Джокер в закрытой психиатрической лечебнице. Однако желая отомстить Бэтмену и всему городу, Лекс Лютор освобождает Джокера и суперзлодеев. При помощи нового секретного оружия банда собирается захватить власть в Готэме, но им противостоит не только Бэтмен, но и все супергерои DC.