В сюжете детективного триллера «Ужас на глубине 9 миль» в пустыне Сахара группа ученых обнаружила загадочную и очень глубокую подземную пещеру. Для исследовательской деятельности над пещерой создается научный центр. Долгое время ученые работали над строительством шахты, кропотливо прокладывали путь сквозь пески пустыни и грунт в надежде найти неизведанные ранее формы жизни или какие-то интересные открытия, раскрывающие тайны мироздания. Но в один прекрасный день связь с лагерем была утеряна. В исследовательский центр прибывает эксперт по военной безопасности Томас Джексон, чтобы провести расследование произошедшего.
Однако, в лагере он не обнаруживает ученых: вся группа исчезла при загадочных обстоятельствах, оставив вещи и оборудование в пустых комнатах. Неожиданной находкой Томаса становится доктор Дженни Кристенсен — единственная выжившая из группы ученых. Дженни мечтает скорее убраться из этого места, но Томас вынужден провести полное расследование и предоставить отчет руководству. Правда, он даже не подозревает о том, какой ужас таится на глубине девять миль…