Фильм ужасов «Хэллоуин 3: Сезон ведьм» является совершенно отдельным фильмом и никак не связан с историей о маньяке-психопате Майкле Майерсе, убивавшем свои жертвы в канун Дня всех святых. Действия фильма начинаются в Северной Калифорнии, где при странных обстоятельствах происходит убийство пожилого мужчины, а около больницы в который произошло убийство, полиция находит сгоревший автомобиль с изуродованным трупом внутри.
Доктор Дэниэл Чэллис является единственным свидетелем того, как убийца обливает себя бензином после чего совершает самосожжение. Тем не менее, шок проходит и доктор Чэллис соглашается помочь дочери убитого пациента провести собственное расследование происходящего ужаса. Расследование приводит их в город Санта Моника, где безумный конструктор игрушек делает маски для Хэллоуина, которые способны убивать детей.