Мультфильм «Лило и Стич 2: Большая проблема Стича» продолжает рассказывать о приключениях лучших друзей девочки Лило и инопланетянина Стича. Жизнь Стича на планете Земля проходит беззаботно и спокойно, просто идеальное место для укрытия. Маленькая Лило хочет наследовать свою мать и Стич помогает ей подготовиться к большому танцевальному конкурсу на острове. Все шло прекрасно, пока на Гавайях не высаживаются инопланетные существа, эксперименты под номером 626. Такой же номер был присвоен и самому Стичу, он оказывается в опасной ситуации. Лило вместе с сестрой Нани и доктором Джамбо отправляется на помощь маленького друга.