Действия аниме «Оборотни» переносят зрителя в альтернативную реальность, в которой Германия одержала победу во Второй мировой войне, и это привело к развитию совершенно другой истории человечества. Япония была повержена, а некогда красивый и быстро развивающийся Токио погряз в массовых беспорядках. Повсюду царит хаос, жестокость и насилие. Для борьбы с агрессивными протестующими, террористами и повстанцами, именующими себя “Секта”, с которыми обычная полиция не в состоянии справиться, власти создают специальные подразделения под названием “Церберы”.
Одним из оборотней полиции является молодой парень Кадзуки Фусэ. Во время выполнения очередного задания по устранению террористов, Кадзуки не смог выстрелить в юную девушку-курьера из “Секты”, которая, чтобы не попасть под арест, подорвала себя прямо на его глазах. Это нанесло парню серьезную психологическую травму и навсегда изменило его жизнь, а так же привело к неприятностям более глобального плана.