Действия сериала «Борджиа» разворачиваются в Италии в эпоху Возрождения и повествуют о влиятельном семействе, члены которого прибегали к любым уловкам и методам, чтобы добраться на вершину власти. Богатейшая итальянская династия с испанскими корнями Борджиа очень знаменита в Риме, но в городе мало кто скажет доброе слово о семействе, у него имеется множество недоброжелателей и врагов. Тем не менее, глава семейства и весьма амбициозный церковный деятель Родриго Борджиа становится новым Папой Римским и меняет свое имя на Александра VI. В религии, как и в политике все имеет свою цену, процветают интриги, а к власти приходят обманным путем.
Свою должность Родриго получил при помощи подкупов, шантажа и даже кровопролития. Он усиливает свою власть, но остается преданным своей семье, так же, как и его сын Чезаре, всеми силами устраняющий противников. В руках Папы Римского Александра VI судьбы монархов и высшего сословия, он может изменить судьбу многих знатный и богатых семей. Однако, всегда найдется человек крайне недовольный правлением Папы. Им становится могущественный кардинал Джулиано делла Ровере, который выходит на тропу войны с кланом Борджиа.