В сюжете драматического триллера «Тайна в его глазах» после выхода на пенсию судебный советник Бенхамин Эспосито решил написать роман, в основу которого легло реальное уголовное дело, расследованием которого он занимался двадцать пять лет тому назад. В далеком 1974 году Эспосито было поручено провести расследование дела, касающегося изнасилования и убийства молодой женщины в одном из районов города.
Муж убитой, Рикардо Моралес, больше всего хочет, чтобы убийцу поймали и отправили за решетку с пожизненным приговором. Понимая страдания Моралеса Эспосито обещает ему поймать преступника. Вместе со своим другом и коллегой Пабло, а так же с новым секретарем суда, в лице красивой и очаровательной Ирене Хейстингс, Эспосито начинает расследование запутанного дела, которое очень сильно повлияет на его дальнейшую жизнь.