В центре аниме-фильма «Ловцы забытых голосов» японская школьница Асуна, которая потеряла отца и живет с мамой. Большую часть времени девочка проводит наедине с собой, так как мама много работает в больнице и редко бывает дома. Асуна хорошо учится, но у нее мало друзей. Она привыкла быть одна, проводить вечера на склоне холма и любоваться природой родной деревни, а так же слушать старенькое радио.
Однажды Асуна знакомится с парнем по имени Сюн, который спасает ее от ужасного монстра, напавшего на нее по дороге на любимый склон. Они становятся хорошими друзьями, но вскоре Асуна узнает, что Сюн умер. Но существует потусторонний мир Агарту, где теперь живет Сюн. Вместе со своим школьным учителем-проводником Морисаки, а так же братом погибшего юноши Сином, девочка отправляется в загадочный подземный мир, чтобы отыскать Сюна к которому она испытывает нежные, романтические чувства.