В центре сюжета фантастического фильма «Последняя Мимзи Вселенной» — мальчик Ноа и его младшая сестренка Эмма, которые стали счастливыми обладателями уникальных вещей из будущего. Таинственную коробку с необычными вещами, которые по виду похожи на игрушки, дети нашли совершенно случайно на берегу океана. Играя со своими новыми находками Ноа и Эмма становятся гораздо умнее, игрушки таинственным образом действуют на умственные способности детей и постепенно превращают их в маленьких гениев.
Конечно же такие перемены не могут остаться незамеченными и родители всерьез начинают беспокоиться о своих малышах, ведь они все время играют со своими новыми игрушками. Особенно настораживает поведение Эммы, которая заявляет, что ее игрушка — кролик по имени Мимзи является ее учителем и прибыл из далекого будущего…