Сюжет фильма «Шестое чувство» рассказывает о девятилетнем мальчике по имени Коул, который отличается от обычных детей и живет в постоянном страхе. Его повсюду преследуют страшные видения – призраки умерших людей, которые были убиты.
Лечащий ребенка детский психиатр Малкольм Кроу пытается понять являются ли истории Коула вымыслом или реальностью. В симптомах болезни он прослеживает сходство с анамнезом своего бывшего пациентом, который покончил с собой на глазах Малкольма и его жены.
У доктора и самого имеются серьезные психологические проблемы в семье, они с женой очень отдалились друг от друга и Малкольм мучается переживаниями. Он всеми силами старается помочь Коулу, проникая в его мир страха и чудовищной боли, но шестое чувство не подсказывает ему, что случай мальчика имеет прямое отношение к нему самому.